El Consejo de Administración (CONAF) del FONDEP es el máximo órgano encargado de la administración de la institución, y está integrado por cinco representantes, designados mediante resolución suprema, por un periodo de cuatro años:

1. Un representante del Ministerio de Educación
2. Un representante del Consejo Nacional de Educación
3. Un representante del Colegio de Profesores del Perú
4. Un representante de los gobiernos regionales (ANGR)
5. Un representante del Ministerio de Economía y Finanzas

Funciones

• Aprobar la Agenda y convocatorias oficiales del CONAF
• Orientar la conducción de las reuniones ordinarias y extraordinarias del CONAF
• Monitorear y evaluar la ejecución de los acuerdos del CONAF
• Representar o delegar representatividad oficial del FONDEP ante organismos nacionales e internacionales
• Garantizar que se cumpla con el objeto, naturaleza, finalidad, así como las funciones establecidas para el CONAF por la Ley 28332 Ley del FONDEP y su Reglamento DS 005.205-ED.
• Otras que el CONAF le encargue

Consejeros

Los consejeros del CONAF, cumplirán las funciones que están establecidas en el Art. 14 del Reglamento de la Ley del FONDEP; DS. N° 005-2015-ED.

Nuestro actual CONAF está formado por:

Alindor Bazán Hernández, presidente y representante del Minedu en el periodo 2022-2026.

Francisco Fidel Rojas Luján, representante del Consejo Nacional de Educación en el periodo 2022 – 2026.
Pablo Heli Ocaña Alejo, representante del Colegio de Profesores del Perú en el periodo 2023-2027.

Isabel Lucía Matías Elías, representante alterno del Ministerio de Economía y Finanzas (RS N°013-2022-MINEDU), en el periodo 2022-2026.

Irene Marleni Tito Mamani, representante de los gobiernos locales en el periodo 2023-2027.

Isabel Marinho Torres, representante alterno de los gobiernos locales en el periodo 2023-2027.